أنشئت جامعة إبن سيناء في العام 2000م بإسم كلية الخرطوم للعلوم الطبية وذلك بموجب القرار رقم (5) بتاريخ 20 مايو 2000م والصادر من إدارة تنظيم مؤسسات التعليم العالي الاهلي والأجنبي بوزارة التعليم العالي والبحث العلمي.وكانت تعرف محلياًباسم "كلية نصر الدين" .
في العام 2016 تم ترفيع الكلية إلى جامعة ابن سينا بموجب القرار رقم (31) بتاريخ 20 مارس 2016 والصادر من وزارة التعليم العالي والبحث العلمي وذلك بعد استيفاء الشروط في جميع النواحي الأكاديمية من البرامج الدراسية والمناهج والهيئة التدريسية والنظم الأكاديمية و ملائمة البنيات التحتية للجامعة.Https: //isu.edu.sd
رؤية الجامعة:
الريادة في المجالات التعليميـة والبحثية والمجتمعية محلياً وإقليمياً وعالمياً.
رسالة الجامعة:
تلتزم جامعة إبن سينا بإعداد أُطُر بشرية ذات مهارات عالية وإستكشاف آفاقاً بحثية جديدة في المجالات الاستراتيجية للدولة لتنمية المجتمع.
أهداف الجامعة:
(1)إعداد أُطُر مزودة بالمقدرات العلمية والمهارات التي تساهم في تنمية المجتمع
(2)توفير متطلبات سوق العمل المحلي والعالمي بأطر ملتزمة بالاخلاق المهنية.
(3)بناء أُطُر قيادية فكرية في مجالات المعرفة المختلفة
(4)إبتكار برامج دراسية وتقنيات تنموية مناسبة لظروف السودان لتلبية حوجة المجتمع.
(5)المساهمة فى مواكبة وتشجيع البحث العلمي وتقديم نماذج مبتكرة لحل المشاكل المختلفة في البلاد.
(6)تقديم إستشارات للقطاعين العام والخاص والمشاركة فى توطين التصنيع التكنولوجى.
(7)تعزيز الشراكة العلمية مع المؤسسات العامة والخاصة المشابهة داخلياً وخارجياً
(8)تطبيق نظام ضمان الجودة في مجال التعلم والتعلم وفق المعايير المحلية والعالمية.
(9)السعي باتجاه مواكبة التطور التكنولوجي والعلمي المطرد في مجال التعليم الإلكترونى فى جميع مجالات المعرفة.